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折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒及其檢測(cè)方法

  • 專利類型:發(fā)明專利
  • 有效期:不限
  • 發(fā)布日期:2021-08-11
  • 技術(shù)成熟度:通過小試
交易價(jià)格: ¥面議
  • 法律狀態(tài)核實(shí)
  • 簽署交易協(xié)議
  • 代辦官方過戶
  • 交易成功

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  • 技術(shù)(專利)類型 發(fā)明專利
  • 申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào) CN201510078743.5 
  • 技術(shù)(專利)名稱 折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒及其檢測(cè)方法 
  • 項(xiàng)目單位 貴州省疾病預(yù)防控制中心
  • 發(fā)明人 黃天誼,黃雨婷,張念恒,佘丹婭 
  • 行業(yè)類別 智慧健康-其他
  • 技術(shù)成熟度 通過小試
  • 交易價(jià)格 ¥面議
  • 聯(lián)系人 褚永靜
  • 發(fā)布時(shí)間 2021-08-11  
  • 01

    項(xiàng)目簡介

    本發(fā)明公開了一種折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒及其檢測(cè)方法。所述試劑盒由含鎂模板緩沖液及無鎂單一組合試劑組成,包含了板DNA制備和折疊引物PCR反應(yīng)全套試劑。所述折疊引物以瘧原蟲Cyt b基因作為靶基因,在瘧原蟲屬、種特異位點(diǎn)進(jìn)行設(shè)計(jì),顯著提高了折疊引物PCR檢出4種瘧原蟲的敏感性和特異性,同時(shí)簡化試劑和試驗(yàn)操作。采用本發(fā)明的試劑盒進(jìn)行檢測(cè),使試劑復(fù)雜操作繁重的傳統(tǒng)套式/多重PCR簡化為單一試劑、單管一步擴(kuò)增反應(yīng),即可同時(shí)檢出和鑒定4種瘧原蟲單獨(dú)或混合感染,檢出單種感染的低限均達(dá)到或接近1個(gè)蟲/μl血;在混合感染高、低密度相差100倍時(shí)仍能同時(shí)檢出和準(zhǔn)確鑒定4種原蟲。是省市各級(jí)醫(yī)院和實(shí)驗(yàn)室瘧疾確診和鑒別診斷的可靠手段。
    展開
  • 02

    說明書

    1.一種折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒,所述診斷試劑盒由模板緩沖液和PCR單
    一組合試劑組成;其中所述的模板緩沖液為1×含鎂模板緩沖液1.0ml×2支,或1×含鎂模
    板緩沖液1.0ml×1支和0.1×模板緩沖液預(yù)裝0.5ml管×20支,所述預(yù)裝管每管400μl;其中
    所述的單一組合試劑為折疊引物PCR無鎂單一組合試劑200μl×1支或預(yù)裝PCR管折疊引物
    PCR無鎂單一組合試劑每管10μl×20支;其特征在于:
    所述的1×含鎂模板緩沖液包含以下組分:30mmol Tris-HCl;30mmol KCl;15mmol
    (NH4)2SO4;6.6mmol MgCl2;
    所述的無鎂單一組合試劑包含以下組分:具有不同退火與折疊溫度的折疊引物6條;
    Tris-HCl 30mmol/L;KCl 30mmol/L;NH4SO4 15mmol/L;TMAC 0.001mmol/L;4種核苷酸-
    4dNTP各200μmol/L;DNA聚合酶-Taq酶0.5U;石蠟油15μl;
    所述的具有不同退火與折疊溫度的折疊引物,包括瘧原蟲屬特異公共引物一對(duì),編號(hào)
    Uf-1865、Ur-2855;惡性瘧原蟲(PF)種特異正向引物1條,編號(hào)Ff-2545;間日瘧原蟲(PV)、三
    日瘧原蟲(PM)、卵形瘧原蟲(PO)種特異反向引物各1條,編號(hào)Vr-2343、Mr-2520、Or-2748;
    所述引物的設(shè)計(jì)是在每條引物的5’端添加與3’端互補(bǔ)的核苷酸序列,所述3’端即第2
    ~4堿基起至第8~18堿基,具體序列如下:
    Uf-1865 5'GTCAAATGGCGTGGAAACACACTTCCCTTCTCGCCATTTGATAG 3'
    Ur-2855 5'CTAAGAAGGTTCGATAACCTGTTATCCCCGGCGAACCTTCTTAC 3'
    Ff-2545 5'GCTTCTGGATATTATGATAGATAACATACCAGAAG 3'
    Vr-2343 5'CGGTGATGCTACTTACTTGGAGAATGTTTTGCATCACCT 3'
    Mr-2520 5'GGTATAAAGGATTTTAGTTTATCTCCATGTCCTTTATACG 3'
    Or-2748 5'CGGAAGGATGTAAAAGCACATTTAATATCTTATCCTTCCA 3'
    所述的折疊引物中,每條屬、種特異引物最佳初始退火溫度間至少相差2~3℃;各條引
    物3’5’端互補(bǔ)退火的折疊溫度比引物與模板靶序列的初始退火溫度低1~2℃,各擴(kuò)增片段
    之間的大小相差150bp以上。
    2.如權(quán)利要求1所述的折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒,其特征在于,所述的折
    疊引物中,屬和種特異引物Uf-1865、Or-2748、Mr-2520、Vr-2343的濃度均為87nmol/μL;Ur-
    2855和Ff-2545的濃度均為70nmol/μL。
    3.權(quán)利要求1或2所述的折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒在制備同時(shí)檢測(cè)和鑒定
    臨床、流行病學(xué)樣本中存在的4種瘧原蟲單獨(dú)或混合感染產(chǎn)品中的用途,所述4種瘧原蟲為
    惡性瘧原蟲、間日瘧原蟲、三日瘧原蟲和卵形瘧原蟲,其中卵形瘧原蟲包括經(jīng)典型和變異
    型。
    4.如權(quán)利要求3所述的折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒的用途,其特征在于,所
    述試劑盒的檢測(cè)方法包括樣本模板DNA制備、折疊引物PCR即FP-PCR擴(kuò)增反應(yīng)和擴(kuò)增產(chǎn)物電
    泳分析鑒定,具體方法如下:
    A、樣本模板DNA制備:將1片6mm直徑的濾紙血樣放入試劑盒提供的預(yù)裝0.1×模板緩沖
    液400μl的0.5ml錐形管內(nèi),室溫浸泡5~10分鐘,瞬時(shí)離心洗脫血紅蛋白,吸去全部液體,加
    入1×模板緩沖液50μl,室溫平衡3分鐘,再吸去全部液體;重新加入1×模板緩沖液20~30μ
    l,56℃孵育30分鐘,期間漩渦震蕩30秒×2次,升溫至95℃繼續(xù)加熱20分鐘,期間再次震動(dòng)
    30秒×2次,瞬時(shí)離心10秒,吸取上清5μl作為FP-PCR模板;或整管4℃保存?zhèn)溆?,下次使用?br/>需再次加熱95℃5~10分鐘,漩渦震蕩30秒,瞬時(shí)離心后再吸取上清作為FP-PCR的模板;
    B、折疊引物多重PCR擴(kuò)增反應(yīng):取出凍存試劑盒中預(yù)裝單一組合試劑PCR管,內(nèi)含無鎂
    單一組合試劑10μl,置4℃冰盒回暖后,加入上述含鎂模板緩沖液制備的樣本模板DNA 5μl
    即可上機(jī)反應(yīng),反應(yīng)前先啟動(dòng)PCR儀,待升溫至86℃再放入PCR管;按下列溫度循環(huán)程序連續(xù)
    擴(kuò)增反應(yīng)至少58個(gè)循環(huán),即可獲得擴(kuò)增產(chǎn)物:
    第1循環(huán):(86℃/90s)X 1;
    第2-5循環(huán):(86℃/05s;68℃/10s;64℃/10s;62℃/10s;57℃/10s;
    55℃/05s;75℃/15s;86℃/05s;57℃/10s;55℃/05s;72℃/05s;64℃/10s;62℃/10s;
    75℃/15s)X 4;
    第6-57循環(huán):(86℃/05s;65℃/15s;72℃/10s;75℃/20s)X 52;
    第58循環(huán):(72℃/180s;10℃/180s)X 1;
    C、擴(kuò)增產(chǎn)物電泳分析鑒定:
    取擴(kuò)增產(chǎn)物5~8ul用含GelRed染料的2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分析,在紫外凝膠成像
    儀下觀察攝像,按擴(kuò)增片段大小判定結(jié)果。
    5.如權(quán)利要求4所述的折疊引物多重PCR瘧疾分子診斷試劑盒的用途,其特征在于,所
    述試劑盒檢測(cè)的電泳鑒定標(biāo)準(zhǔn)是:PF種特異帶310bp,PV種特異帶479bp,PM種特異帶658bp,
    PO種特異帶884bp;原蟲密度特高的模板可以同時(shí)出現(xiàn)有990bp瘧原蟲屬特異公共帶,如果
    只有990bp公共帶而沒有任何種特異帶,則說明是4種以外的其他人瘧原蟲感染;健康人血
    樣和空白陰性對(duì)照除少量二聚體外無其他擴(kuò)增條帶。
    展開

專利技術(shù)附圖

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