1.一種鑒定紅鰭東方鲀親子關(guān)系的微衛(wèi)星引物組,其特征在于,所述引物針
對(duì)紅鰭東方鲀基因組的不同連鎖群;所述引物選自如下引物對(duì)中的3-10對(duì):
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2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的微衛(wèi)星引物組,其特征在于,所述引物組由如下引
物對(duì)組成:
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3.一種鑒定紅鰭東方鲀親子關(guān)系的試劑盒,其特征在于,包括權(quán)利要求1
至2中任一項(xiàng)所述的鑒定紅鰭東方鲀親子關(guān)系的微衛(wèi)星引物組。
4.一種鑒定紅鰭東方鲀親子關(guān)系的分子標(biāo)記方法其特征在于采用以下步驟:
(1)選擇下述44對(duì)特異微衛(wèi)星引物進(jìn)行PCR反應(yīng);
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(2)采集不同家系親本和子代個(gè)體的鰭條,提取基因組DNA;
(3)用步驟(2)的基因組DNA為模板,步驟(1)所選擇的44對(duì)微衛(wèi)星
引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
(4)對(duì)步驟(3)的PCR產(chǎn)物用擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳
檢測(cè),硝酸銀染色、顯色后,凝膠在HPscanjetG4010掃描儀成像;
(5)將PCR的電泳檢測(cè)結(jié)果數(shù)字化處理,用遺傳分析軟件進(jìn)行分析;
(6)獲得每個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的排除率,統(tǒng)計(jì)3-10個(gè)標(biāo)記的累積排除率;利用
排除率前5位的標(biāo)記組合使用,完成家系子代與親本的親子關(guān)系鑒定;
(7)利用親本與子代的親子關(guān)系,就能將不同紅鰭東方鲀家系區(qū)分開來。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(3)中,在進(jìn)行PCR擴(kuò)
增時(shí),PCR反應(yīng)總體積為25μL,包括:10×Buffer2.5μL,25mmol/L的
Mg
2+1μL,各2mmol/L的dNTPs1μL,10μmol/L的正、反向引物各1
μL,50ng/μL的模版DNA1μL,TaqDNA聚合酶1U,加適量ddH
2O。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(3)中,PCR反應(yīng)程序
為:94℃預(yù)變性3min,94℃變性30s,退火30s--72℃延伸30s進(jìn)行30個(gè)循
環(huán),最后72℃延伸10min。
7.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(5)中,使用的遺傳分
析軟件為Gel-ProAnalyzer4.5凝膠分析軟件和CERVUSVersion3.0。
8.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(6)中,用遺傳分析軟
件對(duì)電泳譜帶進(jìn)行數(shù)字化處理,計(jì)算每個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的排除率;按照排除率
高低,挑選排序前10位的微衛(wèi)星標(biāo)記,3-10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的累積排除率范
圍為95.79%-99.99%;利用5個(gè)排除率排序在前的微衛(wèi)星標(biāo)記完成了家系親
本與子代的親子關(guān)系鑒定。
9.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(6)中,排除率前5位
的微衛(wèi)星標(biāo)記名稱和序列信息如下: